More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0517 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 202 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 272 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  49.07 
 
 		 297 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  46.23 
 
 		 318 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3201  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 291 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 294 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  43.52 
 
 		 306 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 311 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 311 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 304 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 311 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 311 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  45.05 
 
 		 293 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 143 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 305 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  40.54 
 
 		 308 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 251 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 306 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 308 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 316 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  45.37 
 
 		 324 aa  95.9  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 296 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 291 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 316 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 332 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 315 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 292 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 		 294 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 290 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 322 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 293 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 287 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 301 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.74 
 
 		 291 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 678 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 288 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 123 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 306 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 305 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 305 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 250 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 291 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 327 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 319 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 291 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 291 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.45 
 
 		 291 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 120 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 311 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 282 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 296 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 293 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  39.82 
 
 		 289 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 356 aa  85.9  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.82 
 
 		 291 aa  85.1  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 294 aa  85.1  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 127 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 322 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 112 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 295 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 346 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  37.72 
 
 		 336 aa  84.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  36.08 
 
 		 250 aa  84.3  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  34.44 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 133 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 292 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>