More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3475 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  607  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  45.55 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  42.27 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  33.79 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  29.24 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  38.58 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 112 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 133 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  31.13 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 209 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 180 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  38.69 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.14 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 301 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  40 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 223 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  44.86 
 
 		 336 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 134 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  42.06 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  36.43 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 123 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  39.45 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>