More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1003 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  93.2 
 
 		 250 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  34.14 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  28.63 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 1201 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 530 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  26.8 
 
 		 1278 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  25.79 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  25.4 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.34 
 
 		 1324 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 215 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 515 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  26 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  26 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 216 aa  92  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 533 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.96 
 
 		 961 aa  90.9  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 517 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  27.02 
 
 		 1366 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 519 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 547 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 513 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 296 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 224 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.45 
 
 		 1414 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 289 aa  89  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 547 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 312 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  27.38 
 
 		 1296 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  37.01 
 
 		 526 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  28.02 
 
 		 1370 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 118 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 543 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 232 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 212 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 300 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  27.05 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 440 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 502 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 517 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.41 
 
 		 1355 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 120 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  29.44 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  35.9 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 1341 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.67 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  33.63 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 119 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>