More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0496 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 543 aa  1105    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 542 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 525 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 534 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 548 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 539 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  25.13 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  25.59 
 
 		 509 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  24.64 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  27.36 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  27.36 
 
 		 507 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  24.47 
 
 		 526 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 531 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 535 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 252 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 259 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 546 aa  98.6  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 386 aa  97.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 265 aa  97.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 258 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 260 aa  93.6  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 1066 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 253 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 556 aa  90.9  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2964  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 441 aa  87  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  26.96 
 
 		 529 aa  86.7  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 250 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  30.13 
 
 		 250 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  37.19 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  37.19 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  37.19 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  37.19 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  37.19 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  37.19 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  37.19 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  37.19 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.59 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.59 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.25 
 
 		 953 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 144 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 214 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 259 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 123 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1461  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0783973  normal  0.675596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 214 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  33.33 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.25 
 
 		 953 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  38.68 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 120 aa  80.9  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.65 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 547 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  32.68 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 118 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.25 
 
 		 222 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 135 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 200 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2549  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 123 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>