More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1584 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  34.5 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  34.88 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  34.5 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 252 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  32.57 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 548 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  29.8 
 
 		 1324 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  39.19 
 
 		 538 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  38.93 
 
 		 542 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 509 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 546 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  44.63 
 
 		 509 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 502 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  29.39 
 
 		 1355 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  37.76 
 
 		 507 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 508 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  37.76 
 
 		 507 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 414 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 532 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 494 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 525 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  28.35 
 
 		 1388 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  28.29 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 513 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  32.02 
 
 		 1296 aa  94  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  27.8 
 
 		 1278 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  27.56 
 
 		 1374 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 544 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  42.98 
 
 		 526 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.11 
 
 		 1376 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 534 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 525 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 1201 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  26.38 
 
 		 1366 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  38.58 
 
 		 226 aa  90.5  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 934 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  26.14 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 543 aa  89.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 532 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  27.88 
 
 		 1306 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 961 aa  89  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.98 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 535 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  29.24 
 
 		 1313 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 548 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 		 515 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  27.56 
 
 		 1378 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  27.34 
 
 		 1400 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 537 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 506 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  36.44 
 
 		 531 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  27.34 
 
 		 1344 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.45 
 
 		 1374 aa  85.9  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  26.54 
 
 		 1370 aa  85.9  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 		 519 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.2 
 
 		 1374 aa  85.1  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.35 
 
 		 1355 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  24.41 
 
 		 1342 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  28.29 
 
 		 1414 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  25.67 
 
 		 1298 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 1341 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  24.62 
 
 		 1366 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  27.24 
 
 		 1334 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.39 
 
 		 1378 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  40.68 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 519 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  29.64 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  27.56 
 
 		 1335 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>