More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1483 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  100 
 
 
226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  98.67 
 
 
226 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  95.58 
 
 
226 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  62.22 
 
 
226 aa  289  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  58.74 
 
 
227 aa  272  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  57.99 
 
 
226 aa  255  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  55.09 
 
 
225 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 
227 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  37.84 
 
 
228 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  32.41 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  31.46 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 
230 aa  125  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  30.09 
 
 
231 aa  124  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  33.78 
 
 
236 aa  118  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 
229 aa  116  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.86 
 
 
229 aa  115  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  34.21 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 
517 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
502 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  33.02 
 
 
229 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 
231 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 
231 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 
269 aa  111  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  30.64 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.22 
 
 
953 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  34.11 
 
 
225 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  32.3 
 
 
230 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.61 
 
 
230 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  32.39 
 
 
220 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  32.3 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 
229 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.22 
 
 
953 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
381 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 
217 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  26.99 
 
 
236 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 
230 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 
239 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 
243 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
636 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  33.48 
 
 
226 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 
232 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  30.32 
 
 
221 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 
258 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  31 
 
 
229 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.06 
 
 
227 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 
229 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 
218 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 
425 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 
229 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 
224 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.87 
 
 
227 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 
219 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 
233 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 
227 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.14 
 
 
234 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 
218 aa  101  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.91 
 
 
709 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 
220 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.53 
 
 
225 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  30.7 
 
 
228 aa  101  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 
229 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 
227 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  30.64 
 
 
234 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  31.37 
 
 
229 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.7 
 
 
227 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 
232 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
547 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 
229 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  28.37 
 
 
219 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  28.18 
 
 
227 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  29.86 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  29.86 
 
 
220 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 
226 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  31.96 
 
 
248 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  29.86 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.23 
 
 
438 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  29.06 
 
 
230 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
547 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.53 
 
 
226 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.03 
 
 
476 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>