More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3262 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  34.14 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  26.69 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  26.29 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 1201 aa  99  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 530 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.31 
 
 		 961 aa  95.1  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  27.38 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  33.59 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  33.59 
 
 		 301 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 		 519 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.1 
 
 		 1370 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  28.97 
 
 		 1384 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  40.21 
 
 		 307 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 548 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 531 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  39.18 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 538 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.27 
 
 		 1414 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.62 
 
 		 1355 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  26.74 
 
 		 1296 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  37.62 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  38.38 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 513 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  25.59 
 
 		 1373 aa  82.4  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 502 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 494 aa  82  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 537 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 546 aa  79.3  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  22.05 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 507 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 526 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 535 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  25.77 
 
 		 1400 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  37 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  37 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  37 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  37 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  22.36 
 
 		 1344 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>