More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1399 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  96.6 
 
 		 324 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  97.22 
 
 		 324 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  95.99 
 
 		 324 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  53.65 
 
 		 289 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3588  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0511949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3940  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 329 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  30.6 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 324 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  29.85 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.03 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  28.62 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2328  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  30.8 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  30.1 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  29.34 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.35 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  28.53 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  28.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  28.39 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  27.48 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.65 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>