More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0365 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 299 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  93.6 
 
 		 315 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  65.17 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  68.18 
 
 		 309 aa  394  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  45.2 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.21 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 339 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  39.86 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  37.37 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  36.4 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  38.52 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  37.28 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.15 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  37.64 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  37.86 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  37.27 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  38.87 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  39.19 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.05 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.03 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.79 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.22 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3580  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  29.3 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.41 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.07 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  28.11 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>