More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3586 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  36.86 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.25 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.47 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.44 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  33.08 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  32.45 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.82 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  29 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5280  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.68 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  25.57 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  26.59 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  24.53 
 
 		 350 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 350 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  26.22 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  27.04 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.33 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  26.67 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.64 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  24.63 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  24.63 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  24.45 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  24.62 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  24.53 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>