More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2339 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  45.02 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  46.32 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  42.21 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.51 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  39.49 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  39.13 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  37.86 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  38.54 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  35.91 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  36.4 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  37.41 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  34.05 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  37.16 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.87 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.56 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.88 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.72 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  31.36 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>