More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4889 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  65.09 
 
 		 289 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  54.96 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  55.4 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  50.74 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  54.4 
 
 		 403 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  55.28 
 
 		 403 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.99 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  45.39 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  49.6 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.78 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  48.48 
 
 		 196 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  29.46 
 
 		 1373 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.83 
 
 		 589 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.22 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  31 
 
 		 993 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.83 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29.92 
 
 		 1343 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  29.46 
 
 		 1370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  30.04 
 
 		 1278 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  50 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 1341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.97 
 
 		 1366 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  31.33 
 
 		 1311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.54 
 
 		 1355 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 904 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 961 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  30.4 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.92 
 
 		 1347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.68 
 
 		 1324 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.23 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  28.68 
 
 		 1400 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  28.97 
 
 		 1388 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  28.46 
 
 		 1313 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  27.13 
 
 		 1335 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.59 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  26.77 
 
 		 1296 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 934 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  26.64 
 
 		 1384 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  30.47 
 
 		 1374 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.48 
 
 		 1396 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 677 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 394 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 128 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 940 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.84 
 
 		 443 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  25.29 
 
 		 1376 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  25.4 
 
 		 1373 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.27 
 
 		 1340 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 1349 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1002 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.84 
 
 		 443 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 370 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 407 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.85 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  28.46 
 
 		 663 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 134 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  43.81 
 
 		 414 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  42.45 
 
 		 561 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 566 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  27.27 
 
 		 1404 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 225 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.62 
 
 		 488 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  38.41 
 
 		 705 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 212 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.8 
 
 		 1374 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  25.19 
 
 		 1418 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  26 
 
 		 1374 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.17 
 
 		 1378 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 500 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.71 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 		 235 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>