More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1138 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  59.06 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  54.03 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  36.43 
 
 		 1561 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1279 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 		 882 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1322 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.69 
 
 		 1239 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.17 
 
 		 744 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1289 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 994 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  43.81 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  46.94 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4360  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.95 
 
 		 338 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  36.13 
 
 		 759 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0290  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 614 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 533 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 853 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  28.14 
 
 		 602 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 852 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 336 aa  85.9  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 852 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 940 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  35.04 
 
 		 844 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 748 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 927 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 785 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  31.9 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  31.9 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  31.9 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  31.9 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  32.69 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2109  Fis family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_92  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  29.06 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  26.09 
 
 		 965 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.6 
 
 		 1012 aa  72.4  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.79 
 
 		 1000 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  30 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  32.71 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1134 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  29.29 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 546 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 883 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  35.05 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 1255 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  25.49 
 
 		 507 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0838  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346138 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  25 
 
 		 507 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.13 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0030  hypothetical protein  30.83 
 
 		 976 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1184 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 1201 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>