More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0693 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  100 
 
 		 602 aa  1208    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 859 aa  300  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 618 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 779 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 857 aa  277  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  44.27 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 778 aa  273  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 604 aa  272  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 810 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  34.38 
 
 		 616 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.75 
 
 		 536 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 798 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  34.09 
 
 		 770 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 775 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  42.89 
 
 		 733 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  42.67 
 
 		 498 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 604 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.4 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  41.3 
 
 		 729 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 		 616 aa  253  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 639 aa  253  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 718 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.15 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 738 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 556 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  32.87 
 
 		 749 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 730 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 904 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  50.2 
 
 		 558 aa  243  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  48.59 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  36.63 
 
 		 762 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  50.39 
 
 		 794 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 591 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 636 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.4 
 
 		 1003 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  49.42 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 1354 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 		 517 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 656 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 		 394 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  44.41 
 
 		 533 aa  230  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 572 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 578 aa  229  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 1224 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  48 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.4 
 
 		 368 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 891 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 414 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  49.01 
 
 		 610 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  47.79 
 
 		 343 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  45.59 
 
 		 526 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 406 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  33.4 
 
 		 767 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 915 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  44.49 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  46.18 
 
 		 796 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 670 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 628 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 591 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 1177 aa  216  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  45.45 
 
 		 496 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 431 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  47.25 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  46.79 
 
 		 282 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  50.4 
 
 		 614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  48.25 
 
 		 330 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 493 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 363 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  49.42 
 
 		 584 aa  213  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  46.13 
 
 		 604 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 721 aa  211  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 845 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  43.3 
 
 		 703 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  48.07 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 547 aa  207  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 551 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  50 
 
 		 671 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  40.73 
 
 		 363 aa  206  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 751 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  36.8 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2719  histidine kinase  45.41 
 
 		 449 aa  204  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 761 aa  204  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  32.57 
 
 		 597 aa  203  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  43.85 
 
 		 520 aa  203  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 547 aa  203  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 559 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  34.83 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>