More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2712 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 414 aa  851    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.85 
 
 		 904 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 1003 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.02 
 
 		 775 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.61 
 
 		 510 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  53.46 
 
 		 767 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.22 
 
 		 639 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 406 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 628 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  55.47 
 
 		 558 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 		 891 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 		 517 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1510  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.37 
 
 		 591 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.75 
 
 		 502 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 		 604 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  55.56 
 
 		 622 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2000  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000423497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.09 
 
 		 604 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  50.6 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 859 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  48.99 
 
 		 729 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  49.59 
 
 		 616 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 639 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 355 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  54.02 
 
 		 733 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.61 
 
 		 551 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 		 587 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 		 616 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  54.59 
 
 		 418 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  48.07 
 
 		 794 aa  242  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 730 aa  242  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  48.81 
 
 		 762 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  47.9 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  54.19 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  50.62 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 		 857 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  52.56 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 		 486 aa  235  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  42.81 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  51.79 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  49.11 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 591 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  51.52 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  52.16 
 
 		 584 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  52.54 
 
 		 718 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.16 
 
 		 578 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  51.11 
 
 		 610 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.66 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  48.75 
 
 		 671 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 738 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  44.88 
 
 		 282 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 572 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 778 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  45.49 
 
 		 282 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 645 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  47.74 
 
 		 770 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 645 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 		 618 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.02 
 
 		 457 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  44.86 
 
 		 492 aa  222  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  43.33 
 
 		 496 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  49.78 
 
 		 579 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 		 519 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  44.35 
 
 		 498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  48.48 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  48.48 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 1354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 915 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 810 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 458 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  47.77 
 
 		 703 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1313  histidine kinase  46.94 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0237175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  43.65 
 
 		 520 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  49.78 
 
 		 749 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  47.04 
 
 		 498 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 798 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  43.04 
 
 		 524 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2719  histidine kinase  46.9 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.08 
 
 		 1049 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 1177 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>