More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0666 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
618 aa  1282    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  46.07 
 
 
749 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
604 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
810 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
798 aa  330  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
859 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
483 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  35.48 
 
 
602 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 
559 aa  296  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
510 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.05 
 
 
578 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  46.35 
 
 
733 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
536 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  38.14 
 
 
616 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.2 
 
 
591 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 
738 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.26 
 
 
396 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  57.03 
 
 
343 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
904 aa  276  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  35.86 
 
 
770 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.08 
 
 
556 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.33 
 
 
730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.73 
 
 
472 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  32.94 
 
 
597 aa  266  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  44.19 
 
 
498 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  51.75 
 
 
794 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
718 aa  263  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  42.56 
 
 
499 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
636 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
639 aa  259  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 
583 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  40.29 
 
 
729 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  54.12 
 
 
579 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
915 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.4 
 
 
616 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  39.72 
 
 
762 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  55.78 
 
 
614 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  34.58 
 
 
767 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
1354 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.64 
 
 
583 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  53.41 
 
 
533 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  52.57 
 
 
540 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
778 aa  253  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
604 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
628 aa  253  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  50.95 
 
 
526 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
779 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.2 
 
 
368 aa  251  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
458 aa  251  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
857 aa  250  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
1177 aa  250  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  56.03 
 
 
671 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  52.42 
 
 
583 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
547 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  50.57 
 
 
496 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 
517 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  52.03 
 
 
255 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  51.49 
 
 
330 aa  246  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  52.73 
 
 
558 aa  246  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.56 
 
 
517 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.06 
 
 
479 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  50.39 
 
 
610 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 
1003 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  51.74 
 
 
796 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0166  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
602 aa  243  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719682  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
673 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
891 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  40.12 
 
 
492 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
807 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 
463 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
521 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 
591 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 
396 aa  230  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  40.58 
 
 
622 aa  230  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 
1224 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  50.2 
 
 
604 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
656 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
857 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  50 
 
 
520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  51.33 
 
 
418 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.38 
 
 
457 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  45.31 
 
 
703 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  47.89 
 
 
524 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 
394 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
520 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 
486 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 
553 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
578 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  48.15 
 
 
523 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  31.47 
 
 
727 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
406 aa  220  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
547 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
587 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>