More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0166 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0166  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 602 aa  1233    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  45.59 
 
 		 597 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0007  putative PAS/PAC sensor protein  49.72 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000212043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  29.89 
 
 		 616 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 604 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 618 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 857 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 859 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 775 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 915 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 1177 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  36.86 
 
 		 733 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  34.72 
 
 		 770 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  43.02 
 
 		 496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1562 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  42.8 
 
 		 558 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  36.07 
 
 		 749 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 1354 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 394 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 1224 aa  207  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 639 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 845 aa  206  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 483 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 604 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 738 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 396 aa  204  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 730 aa  203  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 1003 aa  203  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 778 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 355 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 547 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  41 
 
 		 540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 591 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 807 aa  200  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  41.8 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  45.23 
 
 		 363 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 779 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  42.19 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  41 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  41.94 
 
 		 610 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  33.51 
 
 		 794 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1253 aa  197  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 472 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 628 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 510 aa  194  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  31.53 
 
 		 762 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 578 aa  193  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  33.07 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  44.4 
 
 		 584 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  29.68 
 
 		 602 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  32.01 
 
 		 767 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 718 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 798 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 904 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 520 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 1064 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  38.73 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  42.13 
 
 		 282 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  42.13 
 
 		 343 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 810 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  44.09 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 406 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  43.91 
 
 		 671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 639 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 761 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 636 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 368 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 857 aa  183  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 406 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 363 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 389 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  36.02 
 
 		 729 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 		 498 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 545 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 616 aa  180  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  38.52 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 891 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 457 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 628 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 714 aa  178  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  39.42 
 
 		 330 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  36.47 
 
 		 524 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  40.68 
 
 		 307 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  42.46 
 
 		 614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>