More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0938 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
486 aa  995    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
479 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  46.31 
 
 
583 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.04 
 
 
604 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  42.38 
 
 
526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
591 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  49.79 
 
 
540 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 
483 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  52.74 
 
 
558 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.32 
 
 
536 aa  246  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  50.21 
 
 
733 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 
730 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  45.69 
 
 
496 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 
368 aa  243  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  48.22 
 
 
767 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
639 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 
859 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.75 
 
 
775 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
779 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 
857 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
556 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  46.59 
 
 
579 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2991  sensor histidine kinase  46.82 
 
 
677 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 
545 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 
628 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 
718 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  40.66 
 
 
770 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  49.79 
 
 
533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 
355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
604 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  49.79 
 
 
343 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  47.33 
 
 
729 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  47.9 
 
 
499 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
1003 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
510 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 
904 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
493 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 
616 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.89 
 
 
578 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
457 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
472 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  44.4 
 
 
762 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  31.9 
 
 
524 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  46.84 
 
 
610 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 
386 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  48.31 
 
 
255 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 
618 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
738 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 
502 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
1224 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
517 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 
778 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  48.73 
 
 
749 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
1177 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 
891 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 
414 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  31.64 
 
 
537 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  47.49 
 
 
282 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.83 
 
 
583 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  38.59 
 
 
452 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  47.41 
 
 
671 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 
572 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
807 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  44.77 
 
 
616 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  37.79 
 
 
604 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
639 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  47.95 
 
 
282 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 
1354 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  46.93 
 
 
622 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 
551 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2719  histidine kinase  47.37 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 
394 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  34.66 
 
 
523 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
463 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  43.4 
 
 
307 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 
798 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  48.94 
 
 
794 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
583 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  45.41 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  43.02 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
915 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1510  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
810 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 
591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  46.25 
 
 
614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  51.26 
 
 
584 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  44.44 
 
 
330 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
547 aa  213  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
458 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
406 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1313  histidine kinase  38.82 
 
 
501 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0237175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  42.25 
 
 
498 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 
587 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
363 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>