More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1368 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.38 
 
 
545 aa  994    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
551 aa  1127    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
775 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
891 aa  329  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
904 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
517 aa  320  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 
502 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
730 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
604 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  43.77 
 
 
767 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 
628 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
639 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
578 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
639 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
536 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  38.33 
 
 
762 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  42.56 
 
 
733 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  42.13 
 
 
622 aa  266  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
636 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
604 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
738 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
556 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
645 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  39.7 
 
 
729 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
645 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
618 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  53.2 
 
 
540 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
859 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  32.59 
 
 
616 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
519 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
591 aa  250  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
857 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
718 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.27 
 
 
517 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1003 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  47.18 
 
 
330 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  39.9 
 
 
794 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 
363 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  32.84 
 
 
770 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 
414 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  37.6 
 
 
498 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
1354 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  38.44 
 
 
499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  46.74 
 
 
526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
807 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
778 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  36.87 
 
 
452 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  49.34 
 
 
583 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  50.21 
 
 
533 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 
368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
656 aa  233  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 
396 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
1177 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 
587 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  48.61 
 
 
558 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
798 aa  230  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
486 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  49.55 
 
 
255 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
583 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
472 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
547 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  36.77 
 
 
749 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
810 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
541 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
1562 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  44.84 
 
 
610 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
915 aa  224  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
591 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
616 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  51.83 
 
 
418 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
583 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  33.81 
 
 
602 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  43.75 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 
463 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
845 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
1224 aa  220  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  50 
 
 
671 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
520 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
458 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
779 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  44.15 
 
 
703 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 
381 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  45.14 
 
 
579 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
521 aa  216  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  47.35 
 
 
614 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
1253 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  36.34 
 
 
492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  44 
 
 
343 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  31.65 
 
 
597 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
493 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  49.17 
 
 
584 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  42.75 
 
 
520 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
547 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
389 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
462 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.766844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>