More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2667 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  100 
 
 
498 aa  1003    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  43.42 
 
 
794 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 
738 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.13 
 
 
616 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
1354 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  44.42 
 
 
733 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 
730 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 
779 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
859 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 
604 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  53.57 
 
 
610 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
618 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 
396 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
778 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.75 
 
 
483 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  55.12 
 
 
558 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  38.96 
 
 
762 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
547 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  52.17 
 
 
616 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 
857 aa  256  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  52.36 
 
 
579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  42.67 
 
 
602 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  39.07 
 
 
729 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  51.97 
 
 
343 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
556 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
502 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
604 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 
915 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
519 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  52.14 
 
 
499 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  46.02 
 
 
496 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.6 
 
 
591 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  49.8 
 
 
583 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 
368 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
559 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
891 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.37 
 
 
1224 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.75 
 
 
639 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  46.27 
 
 
749 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  53.17 
 
 
614 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  40.67 
 
 
770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
472 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
1177 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
807 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
775 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
904 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
718 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
636 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  44.48 
 
 
526 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
545 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
798 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.88 
 
 
810 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 
628 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
463 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 
394 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  50.98 
 
 
540 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
541 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  51.04 
 
 
533 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  48.36 
 
 
796 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.4 
 
 
517 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  38.32 
 
 
622 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  52.94 
 
 
671 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
458 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  45.79 
 
 
703 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 
386 aa  229  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
553 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  37.71 
 
 
767 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
1562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  44.37 
 
 
452 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
1253 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
363 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  49.17 
 
 
330 aa  223  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
639 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
510 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  46.27 
 
 
604 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
572 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
645 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  47.77 
 
 
255 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 
845 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
645 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.08 
 
 
1003 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
431 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
656 aa  217  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
591 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
406 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 
493 aa  217  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
583 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  41.9 
 
 
524 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
857 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 
751 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  43.12 
 
 
520 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4047  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 
431 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  50.87 
 
 
584 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>