More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2153 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.23 
 
 		 645 aa  1218    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 645 aa  1337    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 904 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 775 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 891 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 510 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 545 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  30.53 
 
 		 749 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.82 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 639 aa  253  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 578 aa  247  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 604 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 639 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 551 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 859 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 695 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 738 aa  230  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  34.33 
 
 		 533 aa  230  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  36.12 
 
 		 622 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  37.08 
 
 		 729 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 536 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 517 aa  223  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 368 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  42.26 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  35.38 
 
 		 767 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  43.48 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 610 aa  217  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 483 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  35.25 
 
 		 770 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  46.18 
 
 		 540 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  28.52 
 
 		 616 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  44.4 
 
 		 499 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  47.24 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 604 aa  210  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 414 aa  210  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 1166 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  43.53 
 
 		 762 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 636 aa  207  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.766844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 591 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 1166 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  45.24 
 
 		 579 aa  203  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 486 aa  203  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 396 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  42.8 
 
 		 733 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 587 aa  201  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  39.63 
 
 		 452 aa  200  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 1177 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  44.19 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 618 aa  198  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 616 aa  198  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 779 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 915 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 718 aa  197  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  40.82 
 
 		 526 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  45.38 
 
 		 343 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 778 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2991  sensor histidine kinase  43.11 
 
 		 677 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 674 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 1354 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 801 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1762  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 462 aa  194  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00610316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 807 aa  193  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 656 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  40.54 
 
 		 492 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 583 aa  190  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 857 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  27.31 
 
 		 1303 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 1224 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 845 aa  188  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 553 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 472 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  43.75 
 
 		 255 aa  187  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  41.55 
 
 		 282 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  40.28 
 
 		 307 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  41.1 
 
 		 282 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.92 
 
 		 532 aa  184  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 520 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  40.29 
 
 		 794 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 431 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 810 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  37.82 
 
 		 671 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.04 
 
 		 1629 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  42.98 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 767 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  41.7 
 
 		 307 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 1562 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>