More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2444 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  100 
 
 		 610 aa  1248    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 		 859 aa  287  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  51.21 
 
 		 762 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.36 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  45 
 
 		 342 aa  281  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  55.95 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 		 591 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  48.78 
 
 		 583 aa  277  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.37 
 
 		 483 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 		 616 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  47.52 
 
 		 579 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  53.33 
 
 		 733 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.54 
 
 		 738 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 1255 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.33 
 
 		 536 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.7 
 
 		 730 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 396 aa  267  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  53.57 
 
 		 498 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  52.99 
 
 		 794 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  46.02 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  50.77 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  47.75 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  50.2 
 
 		 729 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  49.41 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.4 
 
 		 556 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 778 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 		 1354 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 		 857 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  49.6 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  49.22 
 
 		 770 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.67 
 
 		 517 aa  247  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  49.8 
 
 		 255 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 915 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  53.08 
 
 		 614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  50.59 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 618 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 779 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.56 
 
 		 639 aa  243  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  48.43 
 
 		 616 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  52.34 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 775 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 1224 aa  241  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 		 628 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 		 547 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.56 
 
 		 587 aa  237  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 		 394 aa  236  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  44.1 
 
 		 767 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.05 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  41.36 
 
 		 703 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 639 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  51.26 
 
 		 584 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  50.23 
 
 		 282 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  48.03 
 
 		 749 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  50.23 
 
 		 282 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  48.46 
 
 		 498 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  46.38 
 
 		 796 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 363 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 		 386 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  52.29 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  40.92 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  46.48 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 904 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 510 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.71 
 
 		 1562 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  46.77 
 
 		 330 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 		 1177 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 406 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  49.01 
 
 		 602 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 486 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 545 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  45.72 
 
 		 606 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.11 
 
 		 1003 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  45.7 
 
 		 524 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  49.57 
 
 		 671 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.42 
 
 		 583 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 406 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  43.15 
 
 		 452 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 547 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 559 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  45.04 
 
 		 523 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 572 aa  220  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 431 aa  220  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 807 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 798 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  34.14 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 355 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 810 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4047  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 431 aa  218  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 578 aa  217  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>