More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2129 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  89.72 
 
 		 282 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  51.58 
 
 		 583 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  45.62 
 
 		 762 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.64 
 
 		 368 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 536 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 		 604 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 604 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.42 
 
 		 616 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.14 
 
 		 591 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  50 
 
 		 343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  45.31 
 
 		 540 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 		 517 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  52 
 
 		 857 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 610 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 		 483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 		 730 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  44.72 
 
 		 767 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  47.62 
 
 		 330 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  48.23 
 
 		 770 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 		 556 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  52.21 
 
 		 584 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  50.23 
 
 		 733 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  49.36 
 
 		 496 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 572 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 		 363 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  47.14 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  47.83 
 
 		 729 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 463 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.23 
 
 		 578 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.97 
 
 		 457 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 		 486 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 		 738 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 406 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 639 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 		 718 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 		 859 aa  221  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  48.7 
 
 		 558 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  47.84 
 
 		 671 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  49.55 
 
 		 499 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 406 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 1003 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  46.26 
 
 		 526 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  49.77 
 
 		 749 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  42.91 
 
 		 616 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  48.86 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 628 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 547 aa  215  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 396 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  46.79 
 
 		 602 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 		 355 aa  215  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 639 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  47.49 
 
 		 579 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  48.86 
 
 		 533 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 517 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 414 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 493 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 591 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 502 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  44.69 
 
 		 452 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 583 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 472 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 		 519 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 583 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 394 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 396 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2859  bacteriophytochrome-like protein  46.82 
 
 		 424 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  47.71 
 
 		 622 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 572 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 547 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 587 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2719  histidine kinase  44.25 
 
 		 449 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 		 386 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  43.48 
 
 		 614 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  40.42 
 
 		 796 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 618 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 915 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 547 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 545 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  40.43 
 
 		 703 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 510 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 778 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 1224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 779 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  47.06 
 
 		 794 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  45.7 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  42.01 
 
 		 523 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 1354 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 775 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  44.89 
 
 		 498 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 479 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 636 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 1177 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  44.8 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 521 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 458 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 551 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  43.84 
 
 		 604 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  40.47 
 
 		 524 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 431 aa  191  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>