More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2120 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 547 aa  1130    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  93.97 
 
 		 547 aa  1070    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.47 
 
 		 953 aa  277  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.47 
 
 		 953 aa  276  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 519 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  44.64 
 
 		 703 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  46.86 
 
 		 733 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  39.4 
 
 		 749 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 		 483 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 604 aa  236  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 		 859 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 915 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  48.24 
 
 		 558 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 730 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  47.54 
 
 		 523 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  46.61 
 
 		 583 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 639 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  42.61 
 
 		 526 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  45.49 
 
 		 540 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  45.56 
 
 		 255 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 798 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  45.59 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 618 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 616 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 		 591 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 636 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 775 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 738 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 		 556 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  45.78 
 
 		 343 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 810 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  47.08 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  44.49 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  44.88 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  48.39 
 
 		 614 aa  217  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 		 396 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 517 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  44.15 
 
 		 770 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 1354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 406 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  44.9 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  44.96 
 
 		 330 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 545 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 406 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 553 aa  210  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  38.16 
 
 		 767 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 718 aa  209  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 604 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 779 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  47.62 
 
 		 671 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  44.53 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  43.89 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  41.03 
 
 		 794 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  44.64 
 
 		 282 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 547 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 578 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 904 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 486 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 778 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  44.59 
 
 		 282 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  39.19 
 
 		 616 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 891 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 		 472 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 1177 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  39.74 
 
 		 499 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 559 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  39.51 
 
 		 796 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  42.7 
 
 		 729 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  39.79 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 		 762 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 1224 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 628 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  44.94 
 
 		 604 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  42.91 
 
 		 307 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 1003 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  48.07 
 
 		 584 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 857 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 572 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  42.11 
 
 		 307 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 591 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 1562 aa  191  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  30.41 
 
 		 597 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 1253 aa  190  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 583 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>