More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2086 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 798 aa  1654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  91.23 
 
 		 810 aa  1511    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  40.42 
 
 		 749 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 618 aa  330  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 604 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 779 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 778 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  34.71 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 483 aa  277  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.09 
 
 		 472 aa  277  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  53.85 
 
 		 733 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 915 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  50.56 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 904 aa  268  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 		 738 aa  263  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  52.21 
 
 		 343 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.59 
 
 		 396 aa  260  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.67 
 
 		 559 aa  260  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 		 591 aa  260  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  30.41 
 
 		 602 aa  259  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  53.03 
 
 		 794 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  49.31 
 
 		 718 aa  256  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 		 730 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  55.2 
 
 		 614 aa  255  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  37.61 
 
 		 762 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 859 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  51.15 
 
 		 579 aa  251  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 556 aa  250  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 775 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  48.39 
 
 		 583 aa  247  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 616 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 		 583 aa  244  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 636 aa  244  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  50.79 
 
 		 558 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 583 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 639 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  38.19 
 
 		 729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  50 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 545 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  48.22 
 
 		 770 aa  235  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  51.83 
 
 		 418 aa  234  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  46.95 
 
 		 526 aa  233  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 604 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  44.64 
 
 		 796 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 1354 aa  233  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 520 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 553 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  51.34 
 
 		 671 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 857 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  32.07 
 
 		 767 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 		 396 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  47.89 
 
 		 540 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 521 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 		 363 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  48.19 
 
 		 533 aa  228  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 891 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  47.03 
 
 		 330 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 519 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 628 aa  226  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 458 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 656 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 1003 aa  224  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 493 aa  224  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 547 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 547 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 479 aa  221  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 941 aa  220  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  44.49 
 
 		 610 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  41.3 
 
 		 703 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 807 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 406 aa  218  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 591 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 406 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 394 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 831 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 486 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 1224 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  45.87 
 
 		 523 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 572 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  44.36 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  51.95 
 
 		 584 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 517 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 1177 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  47.95 
 
 		 604 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 551 aa  211  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  46.15 
 
 		 255 aa  211  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 1669 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  45.06 
 
 		 496 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 605 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 762 aa  208  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 751 aa  208  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>