More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1958 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 598 aa  1233    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 729 aa  264  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 342 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  34.14 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1255 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  30.13 
 
 		 893 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1245 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.63 
 
 		 1165 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  28.35 
 
 		 1247 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.66 
 
 		 1247 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.19 
 
 		 1247 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.66 
 
 		 1247 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 		 1248 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  29.47 
 
 		 570 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1245 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.13 
 
 		 1244 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  30.45 
 
 		 778 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1788 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 775 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  28.28 
 
 		 2035 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1102 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.41 
 
 		 2213 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  27.4 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  25.12 
 
 		 1065 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  27.89 
 
 		 714 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 946 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 1574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 1251 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  29.24 
 
 		 935 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 1089 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 2654 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1410 aa  125  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  29.02 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 1069 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  25.82 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  23.78 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  24.34 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  24.01 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.64 
 
 		 768 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 1109 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  39.77 
 
 		 340 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 955 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  25.43 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  27.8 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  25 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.02 
 
 		 912 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  24.79 
 
 		 503 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 937 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 937 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  29.36 
 
 		 937 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 932 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 615 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1681 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1681 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  24.57 
 
 		 507 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  26.71 
 
 		 912 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  23.08 
 
 		 1686 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3519  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  26.11 
 
 		 922 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  25.08 
 
 		 794 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 		 618 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  27.21 
 
 		 928 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 928 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 928 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1093 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  26.72 
 
 		 712 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  25.94 
 
 		 934 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1436 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  26.05 
 
 		 932 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  23.53 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  26.03 
 
 		 931 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 1093 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  26.56 
 
 		 923 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1436 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 937 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 		 940 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 812 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  32.34 
 
 		 378 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 818 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  27.63 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  25.44 
 
 		 937 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 		 753 aa  98.6  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  23.26 
 
 		 941 aa  98.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2947  putative PAS/PAC sensor protein  27.24 
 
 		 598 aa  97.4  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  27.89 
 
 		 830 aa  97.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  44.55 
 
 		 449 aa  97.1  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 1090 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  29.95 
 
 		 906 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 1141 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1490 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0076  GGDEF domain-containing protein  26.47 
 
 		 941 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  26.1 
 
 		 608 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 		 1237 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  27.36 
 
 		 830 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 		 1091 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  21.22 
 
 		 1197 aa  94  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  25.39 
 
 		 782 aa  94  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>