More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5518 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  43.79 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  45.76 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  48.57 
 
 		 289 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  31 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  31 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3204  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 773 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.88 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0885  transcriptional regulator, AraC family  35.03 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.13 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  34.69 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  37.78 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 550 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 485 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4441  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  25 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 533 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.76 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 1201 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 538 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  33.87 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  24 
 
 		 507 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  33.87 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  30.53 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  21.71 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  32 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  33.87 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.06 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.1 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>