More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0346 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  47.62 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  46.94 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  47.08 
 
 		 288 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  46.85 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  45.94 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  32.41 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  31.27 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  31.1 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  31.1 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.1 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.05 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.05 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.05 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.05 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.05 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.27 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1491  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 270 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.955629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  24.48 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  24.67 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  24.31 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  29.28 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2097  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0263  transcriptional regulator, AraC family  21.92 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>