More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0885 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0885  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2961  transcriptional regulator, AraC family  52.07 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0159613  hitchhiker  0.000452365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  48.41 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  33.05 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7234  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0446957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1796  putative regulatory protein  30.69 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.259376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1661  putative regulatory protein  30.69 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0701683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1480  putative regulatory protein  30.69 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1794  putative regulatory protein  30.69 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227844  normal  0.117823 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5636  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.25 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  37.89 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  36.44 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 315 aa  62  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3661  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  20.45 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 338 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.71 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 760 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  35.05 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  27.93 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>