More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2237 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  82.03 
 
 		 309 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  81.37 
 
 		 309 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 550 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 485 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  50.84 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 600 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 307 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4858  response regulator receiver protein  21.99 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00250208  normal  0.0726035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 506 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.07 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 493 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 492 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  22.74 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.17 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.42 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 529 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1172  transcriptional regulator, AraC family  20.07 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.324704  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  34.51 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.98 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  33 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  29.63 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  27.16 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1416  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  29.93 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  23.73 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>