More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6221 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  83.33 
 
 
295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  53.77 
 
 
297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  42.56 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
297 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
303 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  37.15 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
292 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 
309 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
292 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
292 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  34.71 
 
 
303 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 
317 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 
290 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
305 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  33.79 
 
 
289 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 
298 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 
295 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  33.45 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
295 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 
288 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  37.85 
 
 
321 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 
305 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 
307 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 
293 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 
329 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 
295 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 
310 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  35.02 
 
 
305 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
310 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 
290 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  34.26 
 
 
293 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  30.34 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  33.99 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  30.68 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  30.68 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 
296 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30.68 
 
 
296 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 
343 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 
289 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 
290 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 
307 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 
298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 
298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 
298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 
298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 
298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 
295 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  24.15 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  31.75 
 
 
263 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 
311 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
292 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 
299 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  23.65 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  22.92 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 
295 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  41.35 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  30.08 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
294 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>