More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2714 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2097  hypothetical protein  26.48 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  32.27 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4330  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0359782 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  27.53 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2958  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000611309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0470  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  23.69 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  24.9 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  30.12 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2362  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  29.48 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  29.59 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  22.36 
 
 		 276 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6379  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1558  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  20.72 
 
 		 259 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5271  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0620952  normal  0.0372935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4042  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.600459  normal  0.0950634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  33.61 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  23.39 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>