More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4591 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
259 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 
259 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
252 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
259 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  33.98 
 
 
252 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
258 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  33.98 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.25 
 
 
250 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
252 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 
250 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
260 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  26.98 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 
538 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  28.35 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
546 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
414 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.2 
 
 
1388 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 
544 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  37.12 
 
 
507 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  28.4 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  28.4 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  31.92 
 
 
1324 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  28.4 
 
 
231 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  28.4 
 
 
231 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  41.09 
 
 
365 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 
507 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 
532 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  30.38 
 
 
1278 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
940 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  28.79 
 
 
1414 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  26.72 
 
 
1347 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30 
 
 
1344 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  28 
 
 
231 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  30.4 
 
 
1355 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
271 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  28.97 
 
 
1374 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  28.46 
 
 
1384 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 
503 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
494 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29.91 
 
 
1343 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  28.57 
 
 
1374 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
268 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.15 
 
 
1340 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  26.92 
 
 
1335 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 
534 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 
539 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  27.52 
 
 
1370 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
271 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.46 
 
 
1316 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 
934 aa  99.4  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  27.55 
 
 
1373 aa  99  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27.2 
 
 
1313 aa  98.6  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 
519 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
535 aa  98.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
548 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  26.96 
 
 
1306 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  25.69 
 
 
1404 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  45.71 
 
 
386 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
526 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.38 
 
 
1374 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  28.97 
 
 
1334 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
543 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
509 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  26.59 
 
 
1400 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  26.64 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.89 
 
 
1363 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 
525 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 
1201 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  29.07 
 
 
1296 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  27.56 
 
 
1366 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  37.24 
 
 
509 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  29.6 
 
 
663 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
530 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 
904 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 
532 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  25.98 
 
 
1366 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
547 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1947  two component transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.272912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.71 
 
 
226 aa  92.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
547 aa  92  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 
269 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  26.88 
 
 
1347 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.29 
 
 
1378 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.88 
 
 
1355 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
508 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 
502 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>