More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1069 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  86.24 
 
 		 299 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  40.82 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  27.17 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0129  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  23.17 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  34.34 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.16 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.6 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  39.77 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  24.51 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  26.86 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.16 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.45 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  22.86 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  24.26 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.16 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.45 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  29.68 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.45 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.45 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.45 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  25.21 
 
 		 773 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  22.66 
 
 		 507 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  21.4 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.17 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.48 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  22.27 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 1201 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4441  helix-turn-helix domain-containing protein  19.01 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 760 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  21.8 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.69 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.29 
 
 		 497 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0827  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000316121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  21.88 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  19.58 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>