More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6111 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 305 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  93.46 
 
 		 306 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5309  helix-turn-helix domain-containing protein  68.94 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.446177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  32.43 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03989  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3874  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03950  hypothetical protein  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3909  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4584  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4672  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4359  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.12 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4615  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.12 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5632  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.12 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.5 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4552  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.5 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4692  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.5 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.887715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.5 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4561  DNA-binding transcriptional regulator MelR  29.5 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  27.76 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3465  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.8 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0879036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4754  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  23.48 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  30.16 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  21.43 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  28.57 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.37 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  26.97 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.82 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  26.97 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  28.33 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 571 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  20.58 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  36 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 773 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  21.45 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.91 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  33.05 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>