More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1106 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  637    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.9 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  28.15 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  23.08 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  27.78 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  26.47 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  26.47 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.83 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.94 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  38.61 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.5 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  25.5 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  26.52 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  25.33 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  24.22 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  24.22 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  24.91 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4328  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  33.66 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  22.64 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  35.4 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>