More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2672 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  92.37 
 
 		 270 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  93.73 
 
 		 270 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  24.12 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2022  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0521834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0693  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  42.57 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  35.92 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0562  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  21.25 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3111  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.8 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406543  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  32.23 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.33 
 
 		 519 aa  72.4  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  19.84 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  24.27 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  39.36 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.89 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.81 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  27.1 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.73 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 1201 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 440 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.11 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.58 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4426  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>