More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4336 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 344 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.8 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  26.23 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  26.03 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  26.84 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.67 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  28.97 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  27.85 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  25.32 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 315 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  25.32 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 214 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.76 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>