More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4961 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  96.97 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  95.08 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  95.08 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  93.94 
 
 		 279 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  73.38 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  84.02 
 
 		 311 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  80.48 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  80.32 
 
 		 255 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  55.08 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  59.07 
 
 		 224 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  48.65 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  45.54 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  36.28 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  36.07 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 812 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1254 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.05 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  34.68 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  34.02 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 1453 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  41.98 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.33 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  40.74 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1211 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>