More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0341 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  96.97 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  96.97 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  96.97 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  94.7 
 
 		 264 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  94.7 
 
 		 264 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  93.18 
 
 		 279 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  82.79 
 
 		 311 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  79.54 
 
 		 294 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 290 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  79.6 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  77.69 
 
 		 256 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 279 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  54.69 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 279 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  58.14 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  49.1 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  45.09 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  41.89 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  36.73 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  36.07 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 248 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  28.14 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 516 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 812 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1254 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  36.08 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  36.44 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  34.02 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.23 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  29.53 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 397 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  41.98 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  33.88 
 
 		 955 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 1453 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1211 aa  65.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.1 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  40.74 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.26 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  33.65 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  36.13 
 
 		 671 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>