More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2851 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  41.15 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  40.08 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  37.33 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  35.37 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  30.24 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1254 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  37.86 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  40.23 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  48.19 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 933 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  40.95 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  35.71 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.96 
 
 		 1355 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  38.35 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.69 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 986 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  39.8 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  32.56 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 334 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 1246 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  32.8 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  32.11 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  34.45 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.7 
 
 		 1466 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>