More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0991 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  35.43 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  34.12 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  29.97 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.64 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.43 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 345 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.27 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  40.43 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  29.83 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  30.16 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  27.18 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1040  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  40.69 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  27.16 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>