More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1005 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
337 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  43.15 
 
 
345 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
349 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
344 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 
335 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  43.26 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  43.57 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  39.27 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
334 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 
325 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  40.99 
 
 
356 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 
325 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
332 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 
322 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 
318 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  36.91 
 
 
333 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  37.77 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.67 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 
320 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 
330 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
312 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 
333 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 
325 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
320 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
309 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
316 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.18 
 
 
329 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
312 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 
313 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
317 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 
307 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 
311 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 
329 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 
359 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
320 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
317 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 
349 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 
301 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 
308 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 
322 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
313 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 
319 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 
313 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  34.73 
 
 
308 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 
323 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 
318 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  34.3 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.23 
 
 
307 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 
333 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 
234 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 
324 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.82 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 
349 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  35.23 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
349 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
214 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
330 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 
305 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 
322 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  29.78 
 
 
328 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 
295 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
319 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 
301 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
313 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 
303 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
305 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
313 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
313 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 
304 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.51 
 
 
338 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>