More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7080 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  86.6 
 
 		 306 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  86.27 
 
 		 308 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  86.27 
 
 		 308 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  54.28 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  49.49 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  42.3 
 
 		 345 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  41.97 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 348 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 348 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.28 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  33.55 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  33.11 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  33.89 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 325 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 335 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.46 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 349 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.81 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  28.66 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.56 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  33.55 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 333 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  39.19 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>