More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1435 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  46.36 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  43.19 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.34 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  36.66 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.76 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  38.94 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  39.5 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  38.01 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  37.95 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.65 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  34.42 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 214 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  34.42 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.21 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  34.89 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  36.6 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  30.6 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  29.92 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  35.18 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>