More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0664 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  99.3 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  98.94 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  97.54 
 
 		 284 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  71.73 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  71.73 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  71.73 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  71.38 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  71.73 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  71.38 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  71.73 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  71.38 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  32.2 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.43 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 333 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 315 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 315 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 331 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.18 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  28.57 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 325 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 322 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 348 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 348 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  42.59 
 
 		 124 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  26.4 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>