More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4375 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  98.28 
 
 		 348 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  57.51 
 
 		 345 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  58 
 
 		 332 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  41.55 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  39.62 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 308 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 308 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  40.07 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.7 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 		 308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  32.55 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 301 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  33.09 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.93 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  31.38 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.12 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  32.12 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.43 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.26 
 
 		 307 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>