More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0402 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 311 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  71.52 
 
 		 319 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  53.9 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  52.9 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  52.77 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  52.3 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.95 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  44.77 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.96 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  50 
 
 		 342 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  43.41 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 		 351 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.87 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.04 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.18 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 342 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.23 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  32.69 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.49 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 214 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.26 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.74 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  34.8 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>