More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4447 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 297 aa  557  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  50.33 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  44.98 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  47.25 
 
 		 332 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.6 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  42.3 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  42.3 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  42.3 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  43.28 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 318 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.44 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.16 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  37.24 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  35.88 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.05 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.01 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.93 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  35.26 
 
 		 335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  32.78 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.7 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.21 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  43.1 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>