More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  54.28 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  48.48 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 332 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  41.14 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  39.93 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 307 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.14 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.09 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  29.97 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.86 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.09 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.71 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>